Svoju medicínsku kariéru započal v roku 1963 ako študent Lekárskej fakulty Univerzity Komenského (LF UK) v Bratislave. Neskôr ako mladý oftalmológ nastúpil na Očnú kliniku LF UK v Bratislave v budove nemocnice na Mickiewiczovej ulici, odkiaľ sa postupne prepracoval až na post prednostu Očnej kliniky Slovenskej zdravotníckej univerzity v Bratislave. Nemalú časť svojej takmer 50 ročnej kariéry venoval kontinuálnemu vzdelávaniu, absolvoval štúdium a prax na mnohých očných klinikách v zahraničí (Veľká Británia, Malta, Nemecko, či USA). Aj vďaka tomu získal v roku 1998 titul Profesor. Dlhé roky pôsobil aj na poste prezidenta Slovenskej oftalmologickej spoločnosti.
Prof. MUDr. Andrej Černák, DrSc., FEBO je oftalmológ a očný chirurg svetového formátu. Špička v oblasti refrakčnej chirurgie, mikrochirurgie rohovky, šošovky, sietnice, predného a zadného segmentu, ako aj onkooftalmológie.
Vďaka jeho neoceniteľným skúsenostiam v problematike vnútroočných nádorov oka je dodnes vyhľadávaný a žiadaný pacientami z celej Európy.
Medzi zaujímavosti p. Profesora patrí v roku 1996 účasť na olympijskych hrách v Atlante, kde sa ako lekár staral o športovcov slovenského a celosvetového formátu. V roku 2003 absolvoval tiež stáž na univerzite Harvard v Bostone.
Špička medzi svetovými oftalmológmi
Medzi jeho výrazné úspechy patrí v roku 1993 založenie prvej Očnej rohovkovej banky, ktorá dodáva rohovky na transplantáciu pre celé Slovensko. Stal sa tiež priekopníkom v oblasti refrakčnej chirurgie, kde využíva svoje dlhoročné skúsenosti. Už od roku 1993 ako prvý na Slovensku na Očnej klinike v Bratislave na Kramároch vykonal úplne prvú laserovú operáciu očí za pomoci našej lekárky MUDr. Eleny Siskovej Csc. Aj pod jeho odborným vedením sa začala rýchlo rozvíjať refrakčná chirurgia na Slovensku. V súčasnosti spolupracuje očné laserové centrum EXCIMER s viacerými odborníkmi pôsobiacimi na Slovensku i v zahraničí.
Počas celého svojho pôsobenia bol publikačne činný a mimoriadne aktívny aj pri výchove nových oftalmológov. Využíval pritom aj skúsenosti, ktoré získal z 5 ročného pobytu ako oftalmológ-pedagóg v Republike Malta.
Je členom Americkej Kataraktovej a Refrakčnej chirurgie a Európskej Kataraktovej a Refrakčnej chrurgie, predsedom sekcie pre chirurgiu katarakty a refrakčnej chirurgie na Slovensku. Je autorom mnohých odborných publikácií a odborných prednášok na zahraničnej úrovni. Publikoval spolu viac ako 200 slovenských aj zahraničných prednášok (Anglicko, Nemecko, USA, Španielsko, Taliansko, Grécko, Čína, Poľsko, Rakúsko a iné).
Pri príležitosti životného jubilea udelilo Prezídium Slovenskej lekárskej spoločnosti (SLS) pánovi prof. A. Černákovi „Čestnú plaketu T.R. Niederlanda“.
